結論を先に書くと薬局や病院への就職は出来ます。
家賃補助に関して言えば、どちらかと言えば応募される方が気にされることが多く、人事担当者側はほとんど気にしません。
「社内規定に従った待遇の中でご判断して頂ければ」と回答を頂くことがほとんどです。
良い就職先を見つけるポイントはご自身が就職先に何を求めるかになります。
例えば「通勤時間が30分以内」というのが第一優先の方は地域密着の薬局さんになりますし、「年収が高いのが一番重要!」という方は勤務先の場所の指定があると見つかりにくくなります。
基本的には「関西だから」「関東だから」という違いはなく、ご自身のご希望を整理され、それを実現できるであろう職場をお探しになれば問題ないかと思います。
よろしくお願いします。