ご質問ありがとうございます。
結論を先に書くと、会社の規模はそこまで気にしなくても良いです。
それよりもご自身が長く続けられる環境かどうかを重視されるべきです。
M&Aを気にされる方は多いですが、残念ながらインサイダー情報になる可能性もあり、
社長に直接聞いても回答は「しない」としか答えていただけません。
そのため、こちらはいくら考えても解決できないことになります。
ドラッグストアはおっしゃる通り、ここ数十年でかなり大手さんが強く、
ほぼ個人経営に近いドラッグストアはなくなってしまいました。
転職する際に
「通勤できるドラッグストアは全部応募したことがある」
という笑えないことも起きつつあります。
少し古いですが2016年の厚生労働省の調査では全国の調剤薬局は58678件です。
【参考】薬局数・無薬局町村数,都道府県別
https://www.mhlw.go.jp/toukei/youran/indexyk_2_4.html
調剤薬局に関してはどれだけ多く見積もっても、
上場しているくらい大きい会社さんは1000社ないでしょう。
ドラッグストアはまだしも、調剤薬局は中小規模の会社さんが圧倒的に多いので
ご心配されていることはほぼ起こりえないでしょう。
ご参考になれば幸いです。